Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGP8Q6NSW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms