Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms