Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN2Q6IMN6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPRIN2Q6IMN6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPRIN2Q6IMN6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms