Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6AWC8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6AWC8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6AWC8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6AWC8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6AWC8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6AWC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6AWC8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6AWC8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6AWC8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6AWC8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms