Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPECC1LQ69YQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms