Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CARMIL1Q5VZK9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CARMIL1Q5VZK9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms