Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR78Q5VTH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR78Q5VTH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms