Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C12orf60Q5U649 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms