Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX1Q5SQQ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms