Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3AQ59EK9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3AQ59EK9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms