Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF6Q58WW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF6Q58WW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms