Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRDTQ58F21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms