Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHG4Q58EX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1452.2 ms