Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFTN2Q52LD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RFTN2Q52LD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms