Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GREB1Q4ZG55 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GREB1Q4ZG55 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms