Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KHDC1Q4VXA5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms