Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO43Q4G163 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms