Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF212Q495C1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms