Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM50Q3ZCQ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms