Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPTABQ3T906 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNPTABQ3T906 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPTABQ3T906 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms