Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BSXQ3C1V8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BSXQ3C1V8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BSXQ3C1V8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms