Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TWISTNBQ3B726 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TWISTNBQ3B726 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms