Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf21Q32NC0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms