Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC27Q2M243 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms