Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms