Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN21Q16825 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN21Q16825 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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