Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK4Q16654 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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