Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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NFIL3Q16649 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFIL3Q16649 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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