Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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