Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACKR1Q16570 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACKR1Q16570 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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