Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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