Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF56Q15929 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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