Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB30Q15771 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms