Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAM1Q15629 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAM1Q15629 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM1Q15629 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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