Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B3Q15393 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms