Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LAPTM4AQ15012 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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