Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms