Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BECN1Q14457 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
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