Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSG2Q14126 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG2Q14126 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG2Q14126 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms