Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CNGB1Q14028 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
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