Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC2Q13868 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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