Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOFQ13790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOFQ13790 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOFQ13790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOFQ13790 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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APOFQ13790 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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APOFQ13790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOFQ13790 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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