Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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