Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL1Q13616 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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