Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX1Q13596 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX1Q13596 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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