Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf61Q13536 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf61Q13536 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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