Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PICALMQ13492 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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