Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DYNC1I2Q13409 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DYNC1I2Q13409 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms