Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P3Q13401 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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