Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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